Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMP19Q99542 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
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