Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD1Q99460 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms