Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT12Q99456 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT12Q99456 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms