Protein–RNA interactions for Protein: Q99102

MUC4, Mucin-4, humanhuman

Predictions only

Length 2,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC4Q99102 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC4Q99102 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUC4Q99102 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms