Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED4Q96RK1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms