Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CICQ96RK0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CICQ96RK0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms