Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms