Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CR12Q96Q35 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms