Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMTK3Q96Q04 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMTK3Q96Q04 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms