Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms