Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SORCS2Q96PQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SORCS2Q96PQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SORCS2Q96PQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SORCS2Q96PQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SORCS2Q96PQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SORCS2Q96PQ0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SORCS2Q96PQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms