Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms