Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC115Q96NT0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC115Q96NT0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms