Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms