Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC43Q96MW1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC43Q96MW1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms