Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM3

ZFP42, Zinc finger protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP42Q96MM3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFP42Q96MM3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFP42Q96MM3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms