Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms