Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC114Q96M63 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms