Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms