Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD8Q96LT4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms