Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCHS1Q96JQ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DCHS1Q96JQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms