Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC3Q96F86 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms