Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHFRQ96EP1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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