Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRRFQ96E11 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms