Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4CQ96DT6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG4CQ96DT6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms