Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NSUN4Q96CB9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms