Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUNDC1Q96C34 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC1Q96C34 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms