Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC102AQ96A19 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms