Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP13Q92995 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP13Q92995 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP13Q92995 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP13Q92995 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP13Q92995 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP13Q92995 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP13Q92995 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP13Q92995 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP13Q92995 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP13Q92995 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP13Q92995 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP13Q92995 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP13Q92995 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP13Q92995 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP13Q92995 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP13Q92995 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP13Q92995 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP13Q92995 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP13Q92995 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP13Q92995 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP13Q92995 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP13Q92995 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP13Q92995 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP13Q92995 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP13Q92995 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP13Q92995 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP13Q92995 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP13Q92995 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP13Q92995 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP13Q92995 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP13Q92995 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP13Q92995 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP13Q92995 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP13Q92995 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP13Q92995 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP13Q92995 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP13Q92995 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP13Q92995 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP13Q92995 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP13Q92995 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP13Q92995 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP13Q92995 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP13Q92995 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP13Q92995 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP13Q92995 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP13Q92995 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP13Q92995 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP13Q92995 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP13Q92995 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP13Q92995 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP13Q92995 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP13Q92995 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP13Q92995 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP13Q92995 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP13Q92995 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP13Q92995 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP13Q92995 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP13Q92995 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms