Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDAQ92838 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDAQ92838 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDAQ92838 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDAQ92838 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDAQ92838 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDAQ92838 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDAQ92838 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDAQ92838 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDAQ92838 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDAQ92838 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDAQ92838 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDAQ92838 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDAQ92838 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EDAQ92838 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDAQ92838 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EDAQ92838 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDAQ92838 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms