Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASKIN2Q8WXE0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms