Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBLCP1Q8WVY7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms