Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRIM41Q8WV44 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms