Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TSKUQ8WUA8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSKUQ8WUA8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms