Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX54Q8TDD1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX54Q8TDD1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms