Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC110Q8TBZ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms