Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms