Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM58Q8NG06 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms