Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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TMIEQ8NEW7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TMIEQ8NEW7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TMIEQ8NEW7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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TMIEQ8NEW7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMIEQ8NEW7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIEQ8NEW7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIEQ8NEW7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIEQ8NEW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIEQ8NEW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIEQ8NEW7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIEQ8NEW7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIEQ8NEW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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