Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF548Q8NEK5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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