Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BBOF1Q8ND07 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms