Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms