Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms