Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME8Q8N427 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms