Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG2Q8N3U4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms