Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED8Q8IZ13 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED8Q8IZ13 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED8Q8IZ13 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED8Q8IZ13 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED8Q8IZ13 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED8Q8IZ13 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED8Q8IZ13 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED8Q8IZ13 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED8Q8IZ13 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED8Q8IZ13 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED8Q8IZ13 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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