Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC8AQ8IWT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8AQ8IWT6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms