Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms