Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHSY1Q86X52 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHSY1Q86X52 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.6 ms