Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIBP1Q86W92 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP1Q86W92 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms